諮問委員会は、以下に掲げる職務を行う。 1. 実施ルール等制度全般についての検討 2. 目標保有参加者の基準年度・実施年度排出量の確定、検証報告書の査読等の環境省（及び事務局）による事務的業務に対する助言 3. 本制度において温室効果ガスの第三者検証を実施する機関（検証機関）の環境省（及び事務局）による選定・指導業務への助言 なお、諮問委員会の決定に基づき、一部の職務を環境省並びに事務局が代行することを認める。
